Ler Valores

using (SPWeb web = SPControl.GetContextWeb(Context).Site.OpenWeb()) // identifica o site atual
{
    SPList list = web.Lists["Nome da Lista"];  // Lista que contenha algum campo de consulta
    foreach (SPListItem item in list.Items) // iterar entre os items da lista
    {   
       // A linha abaixo é a que faz todo o trabalho =D
        SPFieldLookupValue lookupField = new SPFieldLookupValue(item["NomeCampo"].ToString());
        string lookUpValue = lookupField.LookupValue;
    }
}
 
 
E para atualizar um valor de um campo de consulta, como faço?
 

Atualizar Valores

using (SPWeb web = SPControl.GetContextWeb(Context).Site.OpenWeb()) // identifica o site atual
{
    SPList list = web.Lists["Nome da Lista"];  // Lista que contenha algum campo de consulta
    foreach (SPListItem item in list.Items) // iterar entre os items da lista
    {   
        // Aqui vai um conceito importante, para setar um valor a um campo Lookup você deve passar dois parâmetros:
        // o ID do item, representado como 1 e o Valor realmente do item, representado como "Valor"
        item["Campo"] = new SPFieldLookupValue(1, "Valor");
        item.Update();
    }
}